研究表明，测序技术在病变治疗中有更广泛的应用

英国Mariam Jamal-Hanjani在2024年地图大会(伦敦，10月16-18日)的小型口头会议上讨论研究结果，全基因组测序和单细胞测序不仅可以在识别新的治疗靶点方面提供有价值的见解，而且可以评估最小残留疾病和克服治疗耐药性上的两个演示2024年精确病变学大会分子分析(伦敦，10月16-18日)说明…的相对优点全基因组测序(WGS)与单细胞测序的比较，并为这些技术如何在治疗中得到更广泛的应用提供见解实体病变。

在一项研究中，研究人员使用的数据来自英国国民保健服务基因组医学服务的常规WGS患者急性淋巴细胞白血病(全部)和100，000个基因组项目来创造一个“病变优先–种系晚期管道(摘要93MO)。他们发现与临床相关的基因重组DUX4转录因子——与有利的结果相关——在至少5%的病例中出现。此外，他们能够识别更多的克隆，包括新的目标，这在标准的下一代测序中是看不到的，可能有最小残留疾病监测的效用.

在第二项研究中，单细胞RNA测序患者腹膜病变微环境(TME)的变化胃病变和治疗前后的腹膜转移(GCPM)(摘要165MO)。对来自原发性病变、恶性腹水和腹膜转移的匹配样本，以及来自17名患者的成对治疗前和治疗后进展腹水样本进行单细胞RNA测序和空间转录组学。该研究揭示了终末分化的上皮MUC1+病变细胞具有高的上皮-间质转化，这与不良预后相关。此外，在来自治疗抗性病变患者的腹水样本的腹膜微环境中发现了前病变C1Q+巨噬细胞。观察到C1Q+巨噬细胞和MUC1+病变细胞之间的串扰，在免疫抗性疾病患者中转化生长因子(TGF)-β的产生增加。将这些发现应用于I期试验和免疫疗法队列的事后分析表明，用SHR-1701共同靶向TGF-β和PD-L1通路可能比单独的标准免疫疗法更有效。

MAP 2024_Hanjani_165MO

图。在对GCPM患者的初步分析中，共靶向TGF-β和PD-L1通路似乎带来了临床益处，验证了单细胞RNA测序的发现(MAP 2024，Abstract 165MO)

教授马里亚姆·贾迈勒-汉贾尼来自英国伦敦UCL病变研究所的描述了WGS如何增加了研究的广度，而单细胞测序提供了深度:“WGS在需要全面了解基因组的情况下是有价值的，例如，在已知与重排和拷贝数改变有关的病变中，在需要进行基因重组的病变中种系倾向，用于发现研究以识别潜力新司机更详细地研究病变的演变。相比之下，单细胞测序提供了更高的细胞分辨率，并允许对以下方面进行更深入的探索克隆组成，病变内异质性和TME。“额外的空间转录组学单细胞测序通过绘制TME内不同类型细胞之间的关系以及细胞间的相互作用，进一步为治疗靶向提供信息，从而为研究结果增添了更多深度。

对于贾马尔-汉贾尼来说，在《地图2024》上展示的研究强调了基因组学和转录组学不仅可以揭示转化为新疗法的新机制，还可以改善最小残留疾病评估并帮助规避耐药性。根据需要广度还是深度，类似的研究可用于其他实体瘤类型特别是那些预后不良，目前几乎没有管理策略的患者。然而，只有克服当前的挑战，包括高成本和对高质量新鲜组织样本的需求，才能在临床试验和实践中更广泛地使用WGS和单细胞测序。"